Natxiondo se encuentra en el municipio de Ispaster, a 48 Km. de Bilbao, 75 de Donostia-San Sebastián y 90 de la frontera francesa. 

Autopista Bilbao-San Sebastián:
salida Amorebieta hacia Gernika. Desde ahí, carretera general Gernika-Lekeitio Km 47,5.